Paper
Paper sind wissenschaftliche Artikel, die Forschungsergebnisse in Fachzeitschriften präsentieren und oft im Studium gelesen werden.
Du findest sie in Fachzeitschriften wie „Nature“ und „Bioinformatics“ oder kannst sie auch in Datenbanken wie „PubMed“ und „NCBI“ oder Suchmaschinen wie „Google Scholar“ recherchieren.
Paper sind durch ihre DOI (Digital Object Identifier) eindeutig identifizierbar und stecken oft hinter Paywalls, die du mit einer TUM- oder LMU-Kennung umgehen kannst.
Hier ein paar interessante Bioinformatik Paper:
- Jumper, J., Evans, R., Pritzel, A. et al. Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold. Nature 596, 583–589 (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03819-2
- Heumos, L., Schaar, A.C., Lance, C. et al. Best practices for single-cell analysis across modalities. Nat Rev Genet 24, 550–572 (2023). https://doi.org/10.1038/s41576-023-00586-w
- Koludarov, I., Senoner, T., Jackson, T.N.W. et al. Domain loss enabled evolution of novel functions in the snake three-finger toxin gene superfamily. Nat Commun 14, 4861 (2023). https://doi.org/10.1038/s41467-023-40550-0
- Altschul, S., Demchak, B., Durbin, R. et al. The anatomy of successful computational biology software.Nat Biotechnol 31, 894–897 (2013). https://doi.org/10.1038/nbt.2721
Bücher
Wenn ihr lieber Bücher lest, empfehlen wir euch vor allem das Buch „Bioinformatics Algorithms – an active Learning Approach“ von Pavel Pevzner, einem bekannten Bioinformatiker! Von diesem Buch gibt es mehrere Ausgaben, jedoch sind alle super.
Darin werden Bioinformatik-typische Probleme wie De Bruijn Graphen für die Zusammenstellung eines Genoms, das Traveling Salesman Problem uvm. behandelt! Volume 1 könnt ihr hier auch lesen.
Eine weitere Empfehlung ist ganz klar Biological Sequence Analysis – probabilistic models of proteins and nucleic acids, die ihr hier auch lesen könnt. Hier geht es generell um die Analyse von DNA, RNA und Proteinsequenzen.
Außerdem darf natürlich Bioinformatics for Dummies nicht fehlen.
Videos
Wer lieber Videos schaut als Bücher zu lesen, ist hier besser aufgehoben.
Hier haben wir ein paar Youtube-Videos von interessanten Accounts vorbereitet
Folgende Accounts können wir empfehlen:
- OMGenomics – Youtube Account von Maria Nattestad, Bioinformatikerin mit hilfreichen und coolen Videos rund um die Bioinformatik!
- Ben Langmead – ein Bioinformatik Youtube Channel! Erklärt Bioinformatik Algorithmen etc.
- 3Blue1Brown – generell nice für das Mathe/Informatik Verständnis
- StatQuest – erklärt für uns wichtige Stochastik Themen wie UMAPs, Lineare Regression etc.
Podcasts
Wer doch lieber Podcasts hört, hat hier ein paar Bioinformatik Vorschläge:
Interessante Links
Wenn das noch nicht genug war, empfehlen wir euch noch folgende Links:
- Ihr könnt AlphaFold2 in diesem Google Colab selber ausprobieren
- Hier findet ihr mehr Infos zur Genomik
- Wie die Sequenzierkosten gesunken sind über die Jahre
- Timeline Bioinformatik und das Human Genome Project
- Algorithmische Bioinformatik Skripte von Professor Heun